国产固相萃取仪在固相萃取中通常的方法是将固体吸附剂装在个针筒状柱子里，使样品溶液通过吸附剂床，样品中的化合物或通过吸附剂或保留在吸附剂上（依靠吸附剂对溶剂的相对吸附）。“保留”是种存在于吸附剂和分离物分子间吸引的现象，造成当样品溶液通过吸附剂床时，分离物在吸附剂上不移动。国产固相萃取仪保留是三个因素的作用：分离物、溶剂和吸附剂。所以，个给定的分离物的保留行为在不同溶剂和吸附剂存在下是变化的。“洗脱”是种保留在吸附剂上的分离物从吸附剂上去除的过程，这通过加入种对分离物的吸引比吸附剂更强的溶剂来完成。

　　国产固相萃取仪因其对沸点低的高分子化合物的精度较高，在生物医药行业有较为广泛的应用。用来分离生物分子的聚合柱长期使用会被污染，从而较低柱效，影响检测的速率和灵敏度。因此，须定期进行清洁。聚合材料的化学稳定性通常以作用力来衡量。般情况下，国产固相萃取仪主要使用硝酸或氢氧化钠溶液来清洗。些反相聚合色谱柱的清洗方法如用聚苯乙烯－二乙烯基苯小球和聚合单体，如CIM RP－SDVB片和Swift柱子，能耐宽的pH范围（通常pH11～13或有时pH0～14），但使用者用强有机溶剂冲洗柱子时要注意，由其交联度决定，当柱子用某些有机溶剂冲洗时就会膨胀或收缩。高于8～10%交联度的聚合物通常有较好的机械性能在水溶液中收缩很少，在有机溶剂中膨胀也不大。

　　为确保国产固相萃取仪再生的效果，建议在使用溶剂冲洗色谱柱之前，了解色谱柱的填料类型以及确保使用的溶剂能与柱子的填料相容。硅胶基质的柱子通常来说都是相容的，但有机聚合物基质的柱子可能会在某些溶剂组合中膨胀或收缩，这样会影响色谱柱的柱效。